定海县和嵊泗县时期
定海县人民政府（1950.5～1953.3）
县长：王裕民（1950.5～1953.3）
嵊泗县特区军管会
中国人民解放军嵊泗特区军事管制委员会（1950.7～1951.3）
主任：鲁突（1950.7～9）
朱亚民（1950.9～1951.3）
嵊泗县人民政府
县长：陶清（1951.3～1953.2）

舟山专员公署时期（1953.3～1959.3）
为巩固国防，加强沿海工作，1953年3月，中共浙江省委通知：成立舟山专员公署。6月，浙江省人民政府根据政务院批准正式发布命令，将原定海县划为定海、普陀、岱山3个县，连同从江苏省划入的嵊泗县设立舟山专区，建立舟山专员公署。1954年4月，象山县从宁波专区划入。
专员：陈侠（1953.3～1955.1）
王裕民（1955.4～1959.2）

舟山县人民委员会时期
1958年11月，国务院决定，撤销舟山专区及所辖定海、普陀、岱山、嵊泗4个县，成立舟山县；象山县划并台州地区；1959年2月，省委任命了舟山县人民委员会负责人。
县长：王道善（1959.2～11）
吴子诚（1960.1～1962.4）

舟山专员公署时期
1962年4月，中共浙江省委报经党中央批准，恢复舟山专区及定海、普陀、岱山、嵊泗4个县建制，增设大衢县（1964年6月撤销）。
专员：王裕民（1962.4～1967.3）

舟山地区军事管制委员会
1966年"文革"后，给全区各级政权机关带事业严重干扰和破坏，并逐步陷于瘫痪、半瘫痪。1967年3月，舟山地区实施军事管制，成立中国人民解放军舟山地区军事管制委员会，领导全区工农渔业生产。
主任：曹思明（1967.3～11）
黄朝天（1967.11～1968.7）
曹思明（1968.7～1970.2）
王景昆（1970.2～1971.3）

舟山地区革命委员会时期
1971年3月，经浙江省革委会批准，成立由军队代表、领导干部代表、群众组织代表组成的舟山地区革命委员会。
主任：铁 瑛（1971.3～1972.7）
王景昆（1972.7～1975.8）
杨映雪（1975.8～1978.9）

舟山地区行政公署时期
1978年9月，舟山地区革命委员会改称舟山地区行政公署。
专员：卢英贤（1978.9～1983.9）
彭国镇（1983.9～1987.3）

舟山市人民政府时期
1987年1月，国务院批准舟山撤地设市，实行市管县体制；3月，市人民政府正式成立，在舟山市第一届人民代表大会选举产生舟山市人民政府以前，由原地区行政公署代理行使市人民政府职权，原专员为市人民政府主要负责人。
主要负责人：彭国镇（1987.3～1977.）
市长：彭国镇（1987.7～1992.7）
夏阿国（1992.7～1997.4）
王辉忠（1997.4～1999.3，其中1997.4～5为代市长）
张家盟（1999.3～2003.4)
郭剑彪（2003.4～)